Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdca4Q9CWM2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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