Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms