Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms