Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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