Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6os1Q9CTN5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Six6os1Q9CTN5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms