Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard3bQ9CSB4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pard3bQ9CSB4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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