Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms