Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg12Q9CQY1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms