Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm16286Q9CQX6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms