Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ykt6Q9CQW1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ykt6Q9CQW1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ykt6Q9CQW1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms