Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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