Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms