Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms