Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms