Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms