Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rpl17Q9CPR4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rpl17Q9CPR4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rpl17Q9CPR4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms