Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2a1Q99PM3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms