Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms