Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms