Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms