Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms