Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms