Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprtQ99M80 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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