Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms