Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcc1Q99LI2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcc1Q99LI2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms