Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnpo2Q99LG2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnpo2Q99LG2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnpo2Q99LG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnpo2Q99LG2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms