Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DhddsQ99KU1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms