Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms