Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Def8Q99J78 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms