Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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