Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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