Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf3Q920N1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf3Q920N1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf3Q920N1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms