Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt16hQ920B9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt16hQ920B9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt16hQ920B9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Supt16hQ920B9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Supt16hQ920B9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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