Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1bQ91YK2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1bQ91YK2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms