Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms