Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Synpo2Q91YE8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms