Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec16bQ91XT4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec16bQ91XT4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms