Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms