Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac11Q91WA3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms