Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms