Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms