Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms