Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms