Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rprd1aQ8VDS4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms