Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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