Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn4Q8VCH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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