Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms