Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmx1Q8VBT0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms