Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms