Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln1Q8R317 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms